1994 [ 平成6年 ]

4月

熊本商科大学を熊本学園大学に、熊本短期大学を熊本学園大学短期大学部に、熊本商科大学付属高等学校を熊本学園大学付属高等学校に、熊本短期大学付属敬愛幼稚園を熊本学園大学付属敬愛幼稚園に名称変更
熊本学園大学外国語学部英米学科、外国語学部東アジア学科、社会福祉学部第一部社会福祉学科、社会福祉学部第二部社会福祉学科設置

1998 [ 平成10年 ]

4月

熊本学園大学大学院社会福祉学研究科社会福祉学専攻修士課程設置

2000 [ 平成12年 ]

2001 [ 平成13年 ]

2002 [ 平成14年 ]

5月

創立60周年記念式典挙行

10月

熊本学園大学短期大学部閉学式典挙行

2003 [ 平成15年 ]

2005 [ 平成17年 ]

2006 [ 平成18年 ]

2007 [ 平成19年 ]

4月

14号館（60周年記念会館）竣工

2009 [ 平成21年 ]